定期大会は沖縄県教職員組合の最高決議機関であり、年１回中央執行委員長が招集します。定期大会では「運動方針」「事業計画」「予算及び決算」「他団体への加入及び脱退」「組合員の身分に関すること」などが決定されます。

定期大会に次ぐ決議機関であり、年２回以上開かれます。中央委員会では「規定及び各部細則」「追加予算、暫定予算及び構成予算」「他団体との連絡提携」「大会に附議すべき重要事項」「役員の辞任」などが決定されます。

中央執行委員会は、定期大会、中央委員会において決議された事項とそれに基づく日常運営に責任をもつ機関です。「決議機関から与えられた事項の執行」「定期大会並びに中央委員会に提出する議案に関すること」「緊急事項の処理」などが決定されます。